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        熱點(diǎn) 搶跑疫情:二代技術(shù)縮短病毒基因測(cè)序時(shí)間

        來(lái)源:常山信息港 發(fā)表時(shí)間:2020-01-23 22:45

          詳情如下:原標(biāo)題:搶跑疫情二代技術(shù)縮短病毒基因測(cè)序時(shí)間本報(bào)記者閻俏如北京報(bào)道武漢肺炎疫情繼續(xù)蔓延的同時(shí),相關(guān)科研工作正在緊鑼密鼓地進(jìn)行。

          2020年1月10日,上海市公共衛(wèi)生臨床中心和公共衛(wèi)生學(xué)院與華中科技大學(xué)武漢市中心醫(yī)院、武漢市疾病預(yù)防控制中心、國(guó)家傳染病預(yù)防控制所、中國(guó)疾病預(yù)防控制中心和澳大利亞悉尼大學(xué)合作,公開(kāi)了2019冠狀病毒基因組。

          經(jīng)數(shù)據(jù)分析,2019-nCoV與2003年爆發(fā)的SARS病毒基因組序列相似度為80%,與2017年2月從國(guó)內(nèi)的蝙蝠中采集到的Bat SARS-like coronavirus isolate bat-SL-CoVZC45基因組序列相似性最高,相似度為88%。對(duì)2019-nCoV病毒株的基因組變異分析為追溯病毒來(lái)源、追蹤病毒株變異路徑、防控新型冠狀病毒引發(fā)的疫情、治療病毒性肺炎提供重要的數(shù)據(jù)基礎(chǔ)與決策支持。

          1月11日,國(guó)家衛(wèi)健委發(fā)布消息,武漢不明原因的病毒性肺炎疫情受到各界廣泛關(guān)注,為維護(hù)全球衛(wèi)生安全,中國(guó)將與世界衛(wèi)生組織分享武漢不明原因的病毒性肺炎病例中檢測(cè)到的新型冠狀病毒基因序列信息。

          與2003年造成“非典”疫情的SARS病毒相比,此次2019冠狀病毒基因測(cè)序完成的時(shí)間大大縮短。

          恒瑞源正首席科學(xué)家周向軍博士向《中國(guó)經(jīng)營(yíng)報(bào)》記者介紹,2003年,SARS病毒基因測(cè)序使用的是第一代技術(shù),此次2019冠狀病毒測(cè)序使用的是第二代技術(shù)Next Generation Sequencing(NGS),相比于第一代技術(shù),第二代技術(shù)測(cè)序完成更加快速、準(zhǔn)確。

          2002年12月,“非典”病例開(kāi)始出現(xiàn),2003年4月13日,加拿大一間實(shí)驗(yàn)室率先宣布破譯了SARS病毒序列。2003年5月1日,美國(guó)《科學(xué)》雜志刊登了兩份“非典”病毒基因組序列研究論文。由美國(guó)和加拿大研究人員組成的兩個(gè)研究小組在論文中證實(shí),“非典”病毒是一種全新的冠狀病毒。

          相比之下,此次新型冠狀病毒疫情從通報(bào)到基因組被破譯僅用時(shí)10天。周向軍介紹,病毒基因序列對(duì)于檢測(cè)、快速診斷、疫苗研發(fā)和藥品研發(fā)都具有重要意義。

          新型冠狀病毒基因序列公布后,國(guó)內(nèi)從事傳染病檢測(cè)的體外診斷行業(yè)公司迅速布局研發(fā),已經(jīng)先后有多家公司宣布推出新型冠狀病毒檢測(cè)產(chǎn)品。

          1月22日,國(guó)家衛(wèi)生健康委辦公廳和國(guó)家中醫(yī)藥管理局辦公室聯(lián)合印發(fā)《新型冠狀病毒感染的肺炎診療方案(試行第三版)》。對(duì)于病例的定義,該診療方案明確,同時(shí)符合流行病學(xué)史(即發(fā)病前兩周內(nèi)有武漢市旅行史或居住史;或發(fā)病前14天內(nèi)曾經(jīng)接觸過(guò)來(lái)自武漢的發(fā)熱伴有呼吸道癥狀的患者,或有聚集性發(fā)?。┖团R床表現(xiàn)為發(fā)熱;具有肺炎影像學(xué)特征;發(fā)病早期白細(xì)胞總數(shù)正?;蚪档?,或淋巴細(xì)胞計(jì)數(shù)減少,可以判斷為疑似病例。

          符合疑似病例標(biāo)準(zhǔn)的基礎(chǔ)上,痰液、咽拭子、下呼吸道分泌物等標(biāo)本進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光RT-PCR檢測(cè)新型冠狀病毒核酸陽(yáng)性;或病毒基因測(cè)序,與已知的新型冠狀病毒高度同源,則判斷為確診病例。

          北京市一家新型肺炎救治定點(diǎn)醫(yī)院的專(zhuān)家向記者介紹,目前北京市醫(yī)療機(jī)構(gòu)對(duì)新型肺炎患者的確診流程是,患者到醫(yī)療機(jī)構(gòu)就診后,醫(yī)生根據(jù)上述診療方案判斷患者是否為疑似病例。將疑似病例隔離后,將患者的痰液、咽拭子、下呼吸道分泌物等標(biāo)本送至各轄區(qū)疾控中心進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光RT-PCR檢測(cè),經(jīng)過(guò)專(zhuān)家會(huì)診,確定是否為確診病例。由于核酸檢測(cè)試劑盒剛剛研制成功,目前暫時(shí)還未下發(fā)到醫(yī)院。

          RT-PCR即逆轉(zhuǎn)錄PCR,是聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的一種廣泛應(yīng)用的變形。聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)作為一種分子生物學(xué)技術(shù),可以完成DNA片段的擴(kuò)增工作,它最突出的優(yōu)勢(shì)就是可以脫離生物,在生物體外開(kāi)展DNA的復(fù)制工作,并且可以將少數(shù)、微量的DNA進(jìn)行很大程度的擴(kuò)增。

          核酸檢測(cè)PCR試劑盒中含有聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)所需要的各種試劑組分,PCR反應(yīng)液混合液中加入檢測(cè)樣品,即可進(jìn)行PCR擴(kuò)增反應(yīng)。PCR擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖電泳染色判斷,陽(yáng)性樣本將在相應(yīng)大小的片段處出現(xiàn)特異性條帶,從而對(duì)感染樣本進(jìn)行確診。

          上述專(zhuān)家指出,春節(jié)期間,廣大群眾要避免到電影院等人流聚集的地方,其染病風(fēng)險(xiǎn)非常大。目前春節(jié)檔電影已經(jīng)全部撤檔。此前,春節(jié)檔電影預(yù)售票房已經(jīng)超過(guò)2億元,從專(zhuān)家角度考慮,這一情況對(duì)于新型肺炎防控具有很大風(fēng)險(xiǎn)。

        本文文章轉(zhuǎn)載自新浪新聞

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